Las personas que se han vacunado han informado de efectos secundarios leves y temporales, como dolor en el lugar de la inyección, fatiga y, algunas veces, fiebre, dolor de cabeza o dolor en los músculos y las articulaciones. Cuando se producen, estos efectos secundarios suelen desaparecer en un par de días. Los participantes informan que los efectos secundarios son más pronunciados después de la segunda inyección. Estos son efectos secundarios comunes a todas las vacunas e indican que el sistema inmunológico del cuerpo está desarrollando protecciones contra el virus.
En casos raros, personas con alergias graves han experimentado reacciones anafilácticas a la vacuna. Esos individuos fueron tratados y se recuperaron. Los protocolos de administración de vacunas exigen observar a los receptores después de la inyección y tratarlos si se produce una reacción alérgica. Los expertos en salud recomiendan que las personas que informen sobre alergias no relacionadas con las vacunas se sometan a una prueba de alergia cutánea antes de recibir la vacuna, y las personas que tengan alergias graves a vacunas, medicamentos o alimentos no deben vacunarse en este momento.
La FDA agregó una advertencia a la vacuna de Johnson & Johnson sobre un efecto secundario poco común que se llama síndrome Guillain-Barré. Unos 100 casos han sido reportados de aproximadamente 12,8 millones de vacunas J&J que han sido administradas hasta la fecha. Previamente la vacuna J&J fue pausada temporalmente para investigar casos extremadamente raros de coágulos de sangre. Es importante destacar que el riesgo de sufrir efectos secundarios graves después de cualquier vacuna de COVID-19 es extremadamente bajo, y mucho más bajo que las complicaciones de la enfermedad misma. El riesgo de desarrollar coágulos de sangre, por ejemplo, es mucho más alto entre la gente que se contagia de COVID-19 que entre quienes reciben la vacuna J&J.